Евразийский сервер публикаций

Евразийский патент № 035747

   Библиографические данные
(11)035747    (13) B1
(21)201791184

 A ]   B ]   C ]   [ D ]   E ]   F ]   G ]   H ] 

Текущий раздел: C     


Документ опубликован 2020.08.05
Текущий бюллетень: 2020-08  
Все публикации: 035747  
Реестр евразийского патента: 035747  

(22)2015.11.27
(51) C12Q 1/68 (2006.01)
C12N 7/00 (2006.01)
C12N 15/864 (2006.01)
C12N 15/866(2006.01)
(43)A1 2017.09.29 Бюллетень № 09  тит.лист, описание 
(45)B1 2020.08.05 Бюллетень № 08  тит.лист, описание  последовательности 
(31)14195464.4
(32)2014.11.28
(33)EP
(86)EP2015/077882
(87)2016/083560 2016.06.02
(71)ЮНИКЬЮРЕ АйПи Б.В. (NL)
(72)Лубельский Яцек, Херменс Вильхельмус Теодорус Йоханнес Мария Кристиан (NL)
(73)ЮНИКЬЮРЕ АйПи Б.В. (NL)
(74)Медведев В.Н. (RU)
(54)ДНК-ПРИМЕСИ В КОМПОЗИЦИИ, СОДЕРЖАЩЕЙ ПАРВОВИРУСНЫЙ ВИРИОН
   Формула 
(57) 1. Способ идентификации и количественного определения избыточной примеси нуклеиновой кислоты в композиции, содержащей парвовирусный вектор, и где этот способ включает следующие стадии:
a) секвенирование указанной композиции для получения случайных прочтений нуклеотидных последовательностей;
b) сравнение случайных последовательностей со стадии а) с нуклеотидной последовательностью биологического образца, используемого при получении композиции, где совпадение между случайным прочтением и нуклеотидной последовательностью биологического образца указывает на примесь нуклеиновой кислоты;
c) определение среднего количества прочтений на парвовирусном векторе; и
d) определение количества прочтений на нуклеотид избыточной примеси нуклеиновой кислоты, которая идентифицируется именно как избыточная, когда ее распределение прочтений не является случайным, и превышает в 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20 или 50 раз среднее количество прочтений в биологическом образце и составляет по меньшей мере 0,001, 0,01, 0,1, 0,2, 0,3, 0,4, 0,5, 0,6, 0,7, 0,8, 0,9, 1,0, 2,0, 3,0, 5,0, 7,0 или 10% от среднего количества прочтений на парвовирусный вектор.
2. Способ по п.1, где секвенирование нуклеиновой кислоты на стадии (а) включает в себя высокопроизводительное секвенирование.
3. Способ по п.1 или 2, где парвовирусный вектор является рекомбинантным вектором аденоассоциированного вируса (рААВ).
4. Способ по любому из пп.1-3, где нуклеотидная последовательность биологического образца выбрана из группы, состоящей из нуклеотидных последовательностей клетки-хозяина, плазмиды, вектора, отличающегося от рекомбинантного парвовирусного вектора, хелперного вируса, и предпочтительно вектор представляет собой бакуловирусный вектор.
5. Способ по п.4, где хелперный вирус представляет собой рекомбинантный аденовирус и/или рекомбинантный вирус простого герпеса.
6. Способ по любому из пп.1-5, где нуклеотидная последовательность биологического образца содержит нуклеотидную последовательность, кодирующую Rep, Cap и/или трансген, где предпочтительно биологический компонент содержит нуклеотидную последовательность, кодирующую трансген, которая фланкирована по меньшей мере одним парвовирусным ITR, и предпочтительно указанный биологический образец содержит нуклеотидную последовательность, кодирующую трансген, которая фланкирована по меньшей мере одним парвовирусным ITR с каждой стороны.
7. Способ по любому из пп.1-6, где избыточную примесь нуклеиновой кислоты количественно определяют во второй или последующей подобной композиции.
8. Способ определения пригодности композиции, содержащей парвовирусный вектор для применения в отношении людей при клиническом лечении, где этот способ включает следующие стадии:
i) количественного определения избыточной примеси нуклеиновой кислоты в композиции парвовирусного вектора способом по любому из пп.1-7; и
ii) определение пригодности композиции, содержащей примесь нуклеиновой кислоты для лечения людей, если примесь нуклеиновой кислоты, как определено выше, присутствует по меньшей мере в 10, 100, 150, 200, 250, 300, 400, 500, 600, 700, 800, 900, 1000, 10000 или 100000 раз меньшем количестве по сравнению с референсной последовательностью и/или трансгеном.
9. Способ по любому из пп.1-8, где композиция, содержащая парвовирусный вектор, представляет собой фармацевтическую композицию.