Бюллетень ЕАПВ "Изобретения (евразийские заявки и патенты)"
Бюллетень 02´2017

  

(11) 

025831 (13) B1       Разделы: A B C D E F G H    

(21) 

201391199

(22) 

2012.09.14

(51) 

A61K 36/06 (2006.01)
C07K 14/00
(2006.01)
A61K 38/00
(2006.01)
C12Q 1/68
(2006.01)

(31) 

61/534,734; 61/564,201

(32) 

2011.09.14; 2011.11.28

(33) 

US

(43) 

2014.04.30

(86) 

PCT/US2012/055604

(87) 

WO 2013/040478 2013.03.21

(71) 

(73) ЛОС-АНДЖЕЛЕС БИОМЕДИКАЛ РЕСЕРЧ ИНСТИТУТ ЭТ ХАРБОР-УКЛА МЕДИКАЛ ЦЕНТЕР (US)

(72) 

Ибрагим Ашраф С., Йиман Майкл Р., Эдвардс Джон Е. Джр., Ло Гуаньпиншэн, Фу Юэ (US)

(74) 

Ловцов С.В., Левчук Д.В. (RU)

(54) 

КОМПОЗИЦИИ ИЗ HYR1-ПРОИЗВОДНЫХ И СПОСОБЫ ЛЕЧЕНИЯ ИМИ

(57) 1. Вакцина, включающая выделенный белок Hyr1 Candida (SEQ ID NO: 1) или его иммуногенный фрагмент, для использования в способе лечения или профилактики инфекции Acinetobacter у млекопитающего.

2. Вакцина по п.1, отличающаяся тем, что упомянутый белок Hyr1 Candida или его фрагмент получен из Candida albicans, Candida krusei, Candida tropicalis, Candida glabrata или Candida parapsilosis.

3. Вакцина по п.1 или 2, отличающаяся тем, что упомянутая инфекция является результатом Acinetobacter baummani.

4. Вакцина по любому из предшествующих пунктов, отличающаяся тем, что иммуногенным фрагментом является фрагмент N-концевой области упомянутого белка Hyr1 Candida.

5. Вакцина по любому из предшествующих пунктов, отличающаяся тем, что иммуногенный фрагмент включает аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 2, или фрагмент Hyr1p, показанный в табл. 1 или 2.

6. Вакцина по любому из предшествующих пунктов, отличающаяся тем, что иммуногенным фрагментом является один или больше из фрагментов Hyr1p, показанных в табл. 1 или 2, или его иммуногенный фрагмент.

7. Вакцина по любому из предшествующих пунктов, отличающаяся тем, что упомянутую вакцину вводят подкожно, как бустер-дозу, или она включает иммуностимулирующий адъювант (такой как квасцы).

8. Вакцина по любому из предшествующих пунктов, отличающаяся тем, что упомянутый Hyr1p или его иммуногенный фрагмент получают рекомбинантно (так как в Saccharomyces cerevisiae) или синтезируют химически.

9. Выделенный полипептид, включающий аминокислотную последовательность любой одной из SEQ ID NO: 3-10 или ее вариантную последовательность, имеющую до трех замен, делеций или добавлений к упомянутой аминокислотной последовательности любой одной из SEQ ID NO: 3-10, причем упомянутый полипептид не включает больше 20 смежных аминокислот из SEQ ID NO: 2.

10. Полипептид по п.9, включающий аминокислотную последовательность любой одной из SEQ ID NO: 3-10.

11. Полипептид по п.9 или 10, отличающийся тем, что аминокислотная последовательность указанного полипептида состоит из 14-20 аминокислот.

12. Полипептид по любому одному из пп.9-11, отличающийся тем, что N-концевым аминокислотным остатком или С-концевым аминокислотным остатком упомянутого полипептида является цистеин; причем аминокислотная последовательность указанного полипептида включает аминокислотную последовательность любой одной из SEQ ID NO: 11-18; или аминокислотная последовательность упомянутого полипептида состоит из аминокислотной последовательности любой одной из SEQ ID NO: 11-18.

13. Выделенный конъюгат, включающий полипептид по любому одному из пп.9-12 и носитель.

14. Конъюгат по п.13, отличающийся тем, что носителем является гемоцианин фиссуреллы (KLH), CRM197 или токсоид столбняка.

15. Конъюгат по п.13, отличающийся тем, что носителем является фаг, дрожжи, вирус, виросома или рекомбинантная вирусоподобная частица или отличающийся тем, что упомянутым конъюгатом является рекомбинантный составной белок.

16. Вакцина, включающая иммуногенное количество полипептида по любому одному из пп.9-12 или конъюгата по любому одному из пп.13-15 и фармацевтически приемлемый наполнитель.

17. Вакцина по п.16, включающая смесь разных полипептидов по любому одному из пп.9-12 или конъюгатов по любому одному из пп.13-15.

18. Вакцина по любому одному из пп.16, 17, отличающаяся тем, что полипептид или конъюгат получен путем синтеза или отличающаяся тем, что упомянутый полипептид или конъюгат получен рекомбинантным путем.

19. Вакцина по любому одному из пп.16-18 для использования при вакцинации млекопитающего (например, человека) против кандидоза или против Acinetobacter.

20. Вакцина по п.19, отличающаяся тем, что она вводится внутримышечно, подкожно или внутрикожно.

21. Способ вакцинации млекопитающего против кандидоза, включающий введение эффективного количества вакцины по любому одному из пп.16-20.

22. Способ вакцинации млекопитающего против Acinetobacter, включающий введение эффективного количества вакцины по любому одному из пп.16-20.

23. Способ получения химерной вакцины, включающий следующие этапы:

(a) получение фага, дрожжей или вируса;

(b) введение в упомянутый фаг, дрожжи или вирус молекулы нуклеиновой кислоты, которая кодирует полипептид по любому одному из пп.9-12 или 13-15;

(c) экспрессия упомянутого полипептида в упомянутом фаге, дрожжах или вирусе;

(d) выделение упомянутого фага, дрожжей или вируса этапа (с), включающего указанный экспрессированный полипептид; и

(e) добавление фармацевтически приемлемого наполнителя к указанному выделенному фагу, дрожжам или вирусу этапа (d).

24. Способ по п.23, отличающийся тем, что полипептид содержится на поверхности упомянутого фага, дрожжей или вируса после этапа (с).

25. Выделенное моноклональное антитело, которое связывается с полипептидом по любому одному из пп.9-12 или конъюгатом по любому одному из пп.13-15.

26. Диагностическая композиция для диагностики кандидоза или инфекции Acinetobacter, включающая антитело по п.25.

27. Фармацевтическая композиция для лечения или профилактики кандидоза или инфекции Acinetobacter, включающая антитело по п.25.

28. Фармацевтическая композиция, включающая поликлональные антитела, которые связываются с полипептидом по любому одному из пп.9-12 или конъюгатом по любому одному из пп.13-15 или которые связываются со смесью разных полипептидов по любому одному из пп.9-12 или конъюгатов по любому одному из пп.13-15.

29. Фармацевтическая композиция по п.27 или 28 для использования при пассивной иммунизации млекопитающего против кандидоза.

30. Фармацевтическая композиция по п.27 или 28 для использования при пассивной иммунизации млекопитающего против Acinetobacter.

31. Способ пассивной иммунизации млекопитающего против кандидоза, включающий введение ему эффективного количества фармацевтической композиции по любому одному из пп.27 или 28.

32. Способ по п.31, отличающийся тем, что млекопитающим является человек.

33. Способ по п.31 или 32, отличающийся тем, что фармацевтическую композицию вводят внутримышечно, подкожно или внутрикожно.

34. Способ пассивной иммунизации млекопитающего против Acinetobacter, включающий введение ему эффективного количества фармацевтической композиции по любому одному из пп.27 или 28.

35. Способ по п.34, отличающийся тем, что млекопитающим является человек.

36. Способ по п.34 или 35, отличающийся тем, что фармацевтическую композицию вводят внутримышечно, подкожно или внутрикожно.

37. Выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая полипептид HYR1, включающий аминокислотную последовательность, выбираемую из CGPSAPESESDLNTP (SEQ ID NO: 11), CGNRDHFRFEYYPDT (SEQ ID NO:12), CGYDSKLFRIVNSRG (SEQ ID NO: 13), CKIKGTGCVTADEDT (SEQ ID NO: 14), CLKNAVTYDGPVPNN (SEQ ID NO: 15), NSKSSTSFSNFDIGC (SEQ ID NO: 16), CEPTHNFYLKDSKSS (SEQ ID NO: 17) и TSRIDRGGIQGFHGC (SEQ ID NO: 18), отличающаяся тем, что полипептид включает в длину менее чем 930 аминокислотных остатков.

38. Выделенная нуклеиновая кислота по п.37, отличающаяся тем, что аминокислотная последовательность состоит из аминокислотной последовательности, выбранный из SEQ ID NO: 11-18.

39. Выделенная нуклеиновая кислота по п.37, отличающаяся тем, что упомянутый полипептид включает в длину меньше чем 900, 800, 700, 600, 500, 400, 300, 200, 100, 90, 80, 70, 60, 50, 40, 30 или 20 аминокислотных остатков.

40. Вектор, содержащий нуклеиновую кислоту по п.37.

41. Клетка-хозяин, содержащая нуклеиновую кислоту по п.37.

42. Набор для обнаружения присутствия Acinetobacter в пробе, включающий по меньшей мере один олигонуклеотид, включающий от 15 до 300 смежных нуклеотидов, которые кодируют белок 1 наружной мембраны Acinetobacter baumannii, белок 2 наружной мембраны Acinetobacter baumannii, белок с сидерофорной активностью к железу Acinetobacter baumannii, белок теплового шока Dnak Acinetobacter baumannii, фактор элонгации G Acinetobacter baumannii, предшественник белка толерантности к органическому растворителю Acinetobacter baumannii, предшественник липопротеина (VacJ) Acinetobacter baumannii, чувствительный к глюкозе порин (подобный OprB) Acinetobacter baumannii, составной мембранный белок AdeA Acinetobacter baumannii, белок деления клеток Acinetobacter baumannii или белок деления клеток FtsZ Acinetobacter baumannii.

43. Выделенный полипептид HYR1, включающий аминокислотную последовательность, выбираемую из CGPSAPESESDLNTP (SEQ ID NO: 11), CGNRDHFRFEYYPDT (SEQ ID NO: 12), CGYDSKLFRIVNSRG (SEQ ID NO: 13), CKIKGTGCVTADEDT (SEQ ID NO: 14), CLKNAVTYDGPVPNN (SEQ ID NO: 15), NSKSSTSFSNFDIGC (SEQ ID NO: 16), CEPTHNFYLKDSKSS (SEQ ID NO: 17) и TSRIDRGGIQGFHGC (SEQ ID NO: 18), отличающийся тем, что полипептид имеет длину меньше чем 930 аминокислотных остатков.

44. Выделенный полипептид HYR1 по п.43 отличающийся тем, что упомянутый фрагмент полипептида имеет длину меньше чем 900, 800, 700, 600, 500, 400, 300, 200, 100, 90, 80, 70, 60, 50, 40, 30 или 20 аминокислотных остатков.

45. Выделенный полипептид HYR1 по п.43, отличающийся тем, что полипептид может быть связан антителом к HYR1.

46. Выделенный полипептид HYR1 по п.43, отличающийся тем, что он является иммуногенным.

47. Выделенный полипептид HYR1 по п.46, отличающийся тем, что он способен вызывать выработку антитела к HYR1 у пациента.

48. Составной белок, включающий полипептид, соединенный с носителем белка, меткой системы "антиген-антитело" или линкерной последовательностью, отличающийся тем, что указанный полипептид включает полипептид HYR1 по любому одному из пп.43-47.

49. Выделенное белковое антитело к Acinetobacter, имеющее специфическую реактивность с полипептидом HYR1 по любому одному из пп.43-47, белком 1 наружной мембраны Acinetobacter baumannii, белком 2 наружной мембраны Acinetobacter baumannii, белком с сидерофорной активностью к железу Acinetobacter baumannii, белком теплового шока Dnak Acinetobacter baumannii, фактором элонгации G Acinetobacter baumannii, предшественником белка толерантности к органическому растворителю Acinetobacter baumannii, предшественником липопротеина (VacJ) Acinetobacter baumannii, чувствительным к глюкозе порином (подобным OprB) Acinetobacter baumannii, составным мембранным белком AdeA Acinetobacter baumannii, белком деления клеток Acinetobacter baumannii или белком деления клеток FtsZ Acinetobacter baumannii.

50. Антитело по п.49, отличающееся тем, что оно является моноклональным.

51. Антитело по п.49, отличающееся тем, что оно является поликлональным.

52. Линия клеток, вырабатывающая моноклональное антитело по п.50.

53. Набор для обнаружения присутствия Acinetobacter в пробе, включающий выделенное белковое антитело к Acinetobacter по пп.43-47.

54. Способ обнаружения молекулы нуклеиновой кислоты Acinetobacter в пробе, включающий контакт упомянутой пробы с двумя или больше олигонуклеотидами, включающими от 15 до 300 смежных нуклеотидов, которые кодируют часть белка 1 наружной мембраны Acinetobacter baumannii, белка 2 наружной мембраны Acinetobacter baumannii, белка с сидерофорной активностью к железу Acinetobacter baumannii, белка теплового шока Dnak Acinetobacter baumannii, фактора элонгации G Acinetobacter baumannii, предшественника белка толерантности к органическому растворителю Acinetobacter baumannii, предшественника липопротеина (VacJ) Acinetobacter baumannii, чувствительного к глюкозе порина (подобного OprB) Acinetobacter baumannii, составного мембранного белка AdeA Acinetobacter baumannii, белка деления клеток Acinetobacter baumannii или белка деления клеток FtsZ Acinetobacter baumannii, амплификацию молекулы нуклеиновой кислоты и обнаружение указанной амплификации.

55. Способ по п.54, отличающийся тем, что амплификацию осуществляют при помощи полимеразной цепной реакции.

56. Способ обнаружения присутствия Acinetobacter в пробе, включающий контакт пробы с белковым антителом к Acinetobacter по п.49 и обнаружение присутствия специфического связывания антитела с пробой, этим обнаруживая присутствие Acinetobacter в указанной пробе.

57. Фармацевтическая композиция, включающая фармацевтически приемлемый носитель и белковое антитело к Acinetobacter по любому одному из пп.49-51 или белковое антитело к HYR1, имеющее специфическую реактивность с белком HYR1 (SEQ ID NO: 9) или его фрагментом.

58. Композиция вакцины для иммунизации пациента против инфекции Acinetobacter, включающая фармацевтически приемлемый носитель и иммуногенное количество полипептида HYR1 по любому одному из пп.43-47, составного белка по п.48, белка HYR1 (SEQ ID NO: 9) или его фрагмента, белка 1 наружной мембраны Acinetobacter baumannii или его фрагмента, белка 2 наружной мембраны Acinetobacter baumannii или его фрагмента, белка с сидерофорной активностью к железу Acinetobacter baumannii или его фрагмента, белка теплового шока Dnak Acinetobacter baumannii или его фрагмента, фактора элонгации G Acinetobacter baumannii или его фрагмента, предшественника белка толерантности к органическому растворителю Acinetobacter baumannii или его фрагмента, предшественника липопротеина (VacJ) Acinetobacter baumannii или ее фрагмента, чувствительного к глюкозе порина (подобного OprB) Acinetobacter baumannii или его фрагмента, составного мембранного белка AdeA Acinetobacter baumannii или его фрагмента, белка деления клеток Acinetobacter baumannii или его фрагмента или белка деления клеток FtsZ Acinetobacter baumannii или его фрагмента.

59. Композиция вакцины по п.58, кроме того, включающая адъювант.

60. Способ лечения или профилактики инфекции Acinetobacter у пациента, нуждающегося в этом, включающий введение терапевтически эффективного количества фармацевтической композиции по п.28 или композиции вакцины по п.57.

61. Способ по п.60, кроме того, включающий совместное введение антибиотика.

62. Способ диагностики инфекции Acinetobacter у пациента, включающий следующие этапы:

(a) получение пробы для проверки от пациента;

(b) контакт упомянутой пробы со средством, которое может связывать выделенную нуклеиновую кислоту, кодирующую белок 1 наружной мембраны Acinetobacter baumannii, белок 2 наружной мембраны Acinetobacter baumannii, белок с сидерофорной активностью к железу Acinetobacter baumannii, белок теплового шока Dnak Acinetobacter baumannii, фактор элонгации G Acinetobacter baumannii, предшественник белка толерантности к органическому растворителю Acinetobacter baumannii, предшественник липопротеина (VacJ) Acinetobacter baumannii, чувствительный к глюкозе порин (подобный OprB) Acinetobacter baumannii, составной мембранный белок AdeA Acinetobacter baumannii, белок деления клеток Acinetobacter baumannii или белок деления клеток FtsZ Acinetobacter baumannii, или полипептид HYR1 по п.41 в подходящих условиях, обеспечивающих специфическое связывание указанного средства с нуклеиновой кислотой или полипептидом; и

(с) сравнение степени специфического связывания в пробе со степенью специфического связывания в контрольной пробе, причем повышенное или пониженное связывание в упомянутой пробе указывает на инфекцию Acinetobacter.

63. Способ по п.62, отличающийся тем, что упомянутым средством является белковое антитело к Acinetobacter по п.48 или олигонуклеотид, включающий от 15 до 300 смежных нуклеотидов, которые кодируют часть белка 1 наружной мембраны Acinetobacter baumannii, белка 2 наружной мембраны Acinetobacter baumannii, белка с сидерофорной активностью к железу Acinetobacter baumannii, белка теплового шока Dnak Acinetobacter baumannii, фактора элонгации G Acinetobacter baumannii, предшественника белка толерантности к органическому растворителю Acinetobacter baumannii, предшественника липопротеина (VacJ) Acinetobacter baumannii, чувствительного к глюкозе порина (подобного OprB) Acinetobacter baumannii, составного мембранного белка AdeA Acinetobacter baumannii, белка деления клеток Acinetobacter baumannii или белка деления клеток FtsZ Acinetobacter baumannii.


наверх