Бюллетень ЕАПВ "Изобретения (евразийские заявки и патенты)"
Бюллетень 1´2010

  

(11) 

013109 (13) B1       Разделы: A B C D E F G H    

(21) 

200800144

(22) 

2006.06.26

(51) 

C07K 14/47 (2006.01)
G01N 33/50
(2006.01)
G01N 33/68
(2006.01)
G01N 33/574
(2006.01)

(31) 

60/694,159

(32) 

2005.06.27

(33) 

US

(43) 

2008.06.30

(86) 

PCT/US2006/024774

(87) 

WO 2007/002574 2007.01.04

(71) 

(73) ИНДИАНА ЮНИВЕРСИТИ РИСЕРЧ ЭНД ТЕКНОЛОДЖИ КОРПОРЕЙШН (US)

(72) 

Хоуэлз Дерек Дж., Хикки Роберт Дж., Малкас Линда Х. (US)

(74) 

Поликарпов А.В., Борисова Е.Н. (RU)

(54) 

МОДИФИКАЦИИ csPCNA ИЗОФОРМЫ И ИХ ПРИМЕНЕНИЕ

(57) 1. Способ выявления раковой изоформы ядерного антигена пролиферирующих клеток (csPCNA) в биологическом образце, включающий

выявление посттрансляционной модификации, включающей метиловый сложный эфир на одном или нескольких аминокислотных остатках csPCNA изоформы в образце, подозреваемом на содержание csPCNA изоформы;

определение присутствия csPCNA изоформы посредством сравнения уровней содержания метиловых сложных эфиров на csPCNA изоформе с незлокачественной изоформой PCNA.

2. Способ по п.1, отличающийся тем, что биологическим образцом является биологическая жидкость организма.

3. Способ по п.1, отличающийся тем, что биологическая жидкость организма выбрана из группы, включающей кровь, плазму, лимфу, сыворотку, плевральный выпот, цереброспинальную жидкость, слюну, мокроту, мочу, желудочный сок, сок поджелудочной железы, асцитическую жидкость, синовиальную жидкость, молоко и сперму.

4. Способ по п.1, отличающийся тем, что биологическим образцом является образец ткани.

5. Способ по п.1, отличающийся тем, что ткань выбрана из группы, включающей ткань молочной железы, ткань предстательной железы, ткань легких, ткань толстой кишки, эпителиальную ткань, соединительную ткань, ткань шейки матки, ткань пищевода, ткань головного мозга, ткань вилочковой железы, ткань щитовидной железы, ткань поджелудочной железы, ткань яичек, ткань яичника, ткань кишечника, ткань мочевого пузыря, ткань желудка, ткань саркомы мягких тканей, ткань остеосаркомы, лейкозную ткань, ткань лимфомы, ткань карциномы, ткань аденокарциномы, ткань плаценты, волокнистую соединительную ткань, ткань половых клеток и их экстракты.

6. Способ по п.1, отличающийся тем, что метиловый сложный эфир присутствует на аспарагиновой кислоте.

7. Способ по п.1, отличающийся тем, что метиловый сложный эфир присутствует на глутаминовой кислоте.

8. Способ по п.1, отличающийся тем, что метиловый сложный эфир присутствует на одном или нескольких из 16 остатков аспарагиновой или глутаминовой кислот на csPCNA изоформе.

9. Способ по п.8, отличающийся тем, что метиловый сложный эфир присутствует на одном или нескольких из 16 остатков аспарагиновой или глутаминовой кислот, соответствующих аминокислотным положениям 3, 85, 93, 94, 104, 109, 115, 120, 132, 143, 174, 189, 201, 238, 255 и 259 csPCNA изоформы.

10. Способ по п.8, отличающийся тем, что метиловый сложный эфир присутствует на одном или нескольких из 16 остатков аспарагиновой или глутаминовой кислот, соответствующих пептидам с модифицированными аминокислотными остатками, выбранными из числа:

где Еm представляет метилэстерифицированный остаток глутаминовой кислоты, a Dm представляет метилэстерифицированный остаток аспарагиновой кислоты.

11. Способ по п.1, отличающийся тем, что выявление csPCNA изоформы осуществляется посредством масс-спектрометрического анализа.

12. Способ по п.11, отличающийся тем, что масс-спектрометрическим анализом является жидкостной хроматографический (LC) масс-спектрометрический (MS) анализ.

13. Способ по п.11, отличающийся тем, что масс-спектрометрический анализ csPCNA пептида выявляет 14 Да смещение массы по сравнению с соответствующим немодифицированным пептидом.

14. Способ диагностирования либо прогнозирования злокачественного новообразования, включающий

выявление раковой изоформы ядерного антигена пролиферирующих клеток (csPCNA) в биологическом образце посредством идентифицирования статуса посттрансляционной модификации csPCNA изоформы, который отличает csPCNA изоформу от незлокачественной изоформы PCNA (nmPCNA); и

диагностирование злокачественного новообразования на основе выявления csPCNA в биологическом образце.

15. Способ по п.14, отличающийся тем, что посттрансляционной модификацией является метилэстерификация.

16. Способ по п.15, отличающийся тем, что метилэстерификация присутствует на одном или нескольких из 16 остатков аспарагиновой либо глутаминовой кислот на csPCNA изоформе.

17. Способ по п.14, отличающийся тем, что посттрансляционная модификация включает определение уровней метилэстерификации csPCNA изоформы и nmPCNA изоформы.

18. Способ по п.16, отличающийся тем, что метиловый сложный эфир присутствует на одном или нескольких из 16 остатков аспарагиновой или глутаминовой кислот, соответствующих аминокислотным положениям 3, 85, 93, 94, 104, 109, 115, 120, 132, 143, 174, 189, 201, 238, 255 и 259 csPCNA изоформы.

19. Модифицированный пептид ядерного антигена пролиферирующих клеток (PCNA), включающий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, включающей:

где Еm представляет метилэстерифицированный остаток глутаминовой кислоты, a Dm представляет метилэстерифицированный остаток аспарагиновой кислоты.

20. Модифицированный пептид по п.19, где пептиды являются посттрансляционно модифицированными.

21. Модифицированный пептид по п.19, где пептиды подвергают стадии протеолитического гидролиза.

22. Модифицированный пептид по п.19, где пептиды являются синтетическими.



наверх